孔雀石手鍊
早在好幾千年前，人類即已知曉水晶石與人體之間的微妙關聯。已有五千年歷史的傳統漢方醫學(中醫)就記載著以磁鐵礦治療耳疾的處方。以現代晶石治療理論而言，磁鐵礦與人體骨骼肯有共振作用，而依據古老中醫的說法，骨骼和耳朵同屬腎臟經派所管轄，據說可以用磁鐵礦來予以刺激活化。
此外，由於黑膽石(赤鐵礦)能鎮定精神，幫助睡眠，而且可以減緩血流速度，達到止血的效果，因此現代水晶石治療法和傳統中醫亦不約而同利用黑膽石來止血和治療失眠。另外，像是愚人金(亦即黃鐵礦)，至今仍被中國人用來治療骨折，而在現代晶石治療上亦然。
人類利用晶石來製作內服藥方和外用軟膏，已有數千年歷史。古埃及人文獻中即記載了關於孔雀石、矽孔雀石、碧玉、黑膽石、玉髓的各種偏方。例如，將研磨成粉的孔雀石和矽孔雀石塗在傷處，具有殺菌和預防感染之效。而這些古老的處方，目前都已得到現代科學的印證。
依循著古老傳統，希臘物理學家蓋倫(Galen)發現黑膽石可以治療頭痛，而羅馬學者普林尼(Pliny)也利用黑膽石來治療血液病症。在中世紀時代，晶石在內科藥典中扮演著極重要的角色，當時許多深受敬重的醫者均大量運用寶石藥方來為病人治病，德國修女希德嘉(Hildegard of Bingen)就是個很好的例子。
許多關於水晶石治病的理論，如今已被現代醫學所採納。不過，晶石治療家依然非常重視治療時所選用石頭是否正確，不論是將它放在脈輪部位進行治療，或是製成精華藥液服用，抑或浸洗受傷感染的部位。畢竟，把外用的晶石藥方拿來作為內服藥，是可能致命的。
